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TransNGS? ATAC-Seq Library Prep Kit for Illumina?

ATAC文庫構(gòu)建試劑盒 適配illumina平臺

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KP171-0112 rxns3960
KP171-0296 rxns28160
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產(chǎn)品詳情介紹

TransNGS? ATAC-Seq Library Prep Kit for Illumina?是針對Illumina高通量測序平臺開發(fā)的,適用于普通哺乳動物細(xì)胞的ATAC文庫構(gòu)建試劑盒,所得文庫可用于單端或雙端測序。該試劑盒采用新型的轉(zhuǎn)座酶技術(shù),針對染色質(zhì)開放區(qū)域建庫測序,僅需3個小時即可完成實(shí)驗(yàn)。所需細(xì)胞量少,10-50000細(xì)胞的起始量均可以獲得高分辨率的測序圖譜。


產(chǎn)品組成

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實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)

文庫產(chǎn)量高


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對3種哺乳動物細(xì)胞以50,000、10,000 cells為起始細(xì)胞投入量進(jìn)行ATAC文庫構(gòu)建。結(jié)果表明, TransGen產(chǎn)品針對不同細(xì)胞及投入量,均可構(gòu)建高產(chǎn)量文庫。


細(xì)胞起始量低

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對不同細(xì)胞投入量(50-1,000 cells)的HeLa細(xì)胞進(jìn)行ATAC文庫構(gòu)建,不同細(xì)胞投入量的擴(kuò)增循環(huán)數(shù)如上表。結(jié)果表明,TransGen產(chǎn)品可用于構(gòu)建低起始量(50個細(xì)胞)的ATAC文庫,文庫產(chǎn)量高,峰型好。


與競品比較

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分別使用TransGen和Company V產(chǎn)品對不同細(xì)胞投入量(5,000-50,000 cells)的HeLa細(xì)胞進(jìn)行ATAC文庫構(gòu)建。結(jié)果表明,TransGen產(chǎn)品的文庫產(chǎn)量、文庫峰型與競品相比,優(yōu)于競品。


下機(jī)數(shù)據(jù)好

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對不同細(xì)胞投入量(50-50,000 cells)的HeLa細(xì)胞進(jìn)行ATAC文庫構(gòu)建,將構(gòu)建后的文庫測序,下機(jī)后進(jìn)行生信分析。結(jié)果表明,TSS富集圖顯示在基因的轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)周圍富集明顯,IGV視圖顯示ATAC在關(guān)鍵位點(diǎn)與H3K4me3基因的ChIP-seq結(jié)果一致,實(shí)驗(yàn)結(jié)果真實(shí)可靠。


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