mNGS病原微生物檢測解決方案
病原微生物可以侵犯人體，引起感染病或傳染病，一直備受臨床關(guān)注。新型冠狀病毒肺炎全球大流行，給世界經(jīng)濟(jì)和人類健康帶來嚴(yán)峻挑戰(zhàn)，更讓病原的精準(zhǔn)快速檢測成為社會迫切的需求。
宏 基 因 組 測 序 （metagenomics next?generation sequencing，mNGS）是基于高通量測序技術(shù)對各種臨床樣本中的全部生物基因組進(jìn)行測序的實驗室診斷技術(shù)，與其它常見微生物鑒定方法相比具有通量大、可同時檢測上萬種微生物等優(yōu)勢，近年來已逐漸應(yīng)用于各種感染性疾病的診斷，對不明原因的危急重感染的病原學(xué)診斷以及新發(fā)突發(fā)傳染病的病原體發(fā)現(xiàn)發(fā)揮了重要作用。
病原微生物宏基因組基于底層測序技術(shù)的高通量優(yōu)勢，可一次性檢測出樣本中所有種類病原微生物測序數(shù)據(jù)，通過專門的病原數(shù)據(jù)庫比對，獲得疑似致病微生物的種屬信息，為疑難危重感染提供快速精準(zhǔn)診斷依據(jù)。
mNGS檢測優(yōu)勢
為滿足臨床病原微生物的檢測，進(jìn)一步為疑難危重感染提供快速精準(zhǔn)的診斷依據(jù)，全式金推出樣本保存、宿主DNA去除、微生物核酸提取及DNA文庫構(gòu)建相關(guān)產(chǎn)品，提供宏基因組文庫制備的上下游整體解決方案。
宿主核酸去除
TransNGS? Host DNA Depletion Kit
本產(chǎn)品適用于從血液、肺泡灌洗液、液化痰液、鼻咽或口咽拭子、胸腹水、腦脊液、羊水等生物樣品中差異性裂解人源細(xì)胞，并去除人源核酸。
產(chǎn)品特點：
? 簡便省時：操作簡便，50 min完成人源宿主核酸去除。
? 高效去除：專用裂解液，高效去除人源宿主核酸，提高微生物檢出率。
? 兼容多種提取平臺：可兼容柱提法及磁珠法等多種下游提取方式。
? 適用樣本范圍廣：適用于血液、肺泡灌洗液、液化痰液、鼻咽或口咽拭子、胸腹水、腦脊液、羊水等多種生物液體樣本。
高效去除宿主核酸
分別使用TransGen 、Company V和Company Q同類產(chǎn)品處理不同樣本，搭配各自適配的柱提法病原微生物核酸提取產(chǎn)品提取核酸，并對宿主保守基因進(jìn)行qPCR定量檢測。結(jié)果表明： TransGen 產(chǎn)品可以有效清除宿主核酸，且清除效率顯著優(yōu)于 Company V 和 Company Q 同類產(chǎn)品。
適用于建庫分析，提高微生物檢出水平
分別以咽拭子、痰液、腹水和胸水去除宿主核酸后提取的產(chǎn)物為樣本，進(jìn)行文庫構(gòu)建及 PE150 測序分析。結(jié)果顯示，TransGen 產(chǎn)品可以顯著降低宿主序列占比。
以 TransGen 、Company V 和 Company Q 產(chǎn)品去除咽拭子宿主核酸前、后提取的產(chǎn)物為樣本，進(jìn)行文庫構(gòu)建及 PE150 測序分析。結(jié)果顯示，TransGen 產(chǎn)品可以顯著提高微生物檢出水平。
核酸提取
EasyPure? Microbiome DNA Isolation Kit
本產(chǎn)品采用硅膠膜離心柱特異吸附微生物DNA，分離富集的DNA適用于多種下游應(yīng)用，包括PCR、qPCR、宏基因組或16S rDNA文庫構(gòu)建等實驗。
產(chǎn)品特點：
? 高質(zhì)量、高得率滿足多種下游檢測需求。
? 嚴(yán)控試劑背景菌污染，降低假陽性風(fēng)險。
? 提取效果好，高、低濃度模板均能獲得高效提取。
? 適用于從適用于從血液、肺泡灌洗液、液化痰液、鼻咽或口咽拭子、胸腹水、腦脊液、羊水等樣本中提取微生物DNA。
將高、低兩種起始量的不同病原菌稀釋液添加至咽拭子、痰液、胸水、腹水樣本中，分別使用TransGen 、Company V 和 Company Q 產(chǎn)品提取核酸，qPCR 檢測提取效果。結(jié)果表明：TransGen 產(chǎn)品對不同樣本中不同微生物的提取效率均優(yōu)于競品。
MagicPure? 32 Microbiome DNA Isolation Kit
本產(chǎn)品利用硅基磁珠特異性吸附微生物DNA，獲得的DNA適用于多種下游應(yīng)用，包括PCR、qPCR、? 宏基因組或16S rDNA文庫構(gòu)建等實驗。
產(chǎn)品特點：
? 高通量提取，操作簡便，速度快。
? 高質(zhì)量、更高得率滿足多種下游多種檢測需求。
? 更低的試劑背景降低假陽性風(fēng)險。
? 適用于32通道磁棒式自動化核酸提取儀。
? 適用于從血液、肺泡灌洗液、液化痰液、鼻咽或口咽拭子、胸腹水、腦脊液、羊水等樣本中提取微生物DNA。
將高、低兩種起始量的不同菌種稀釋液添加至咽拭子、痰液、胸水、腹水樣本中，使用 TransGen 柱提法和磁珠法產(chǎn)品提取核酸，qPCR 檢測提取效果。結(jié)果表明，TransGen 磁珠法與柱提法產(chǎn)品均可對高、低起始量樣本進(jìn)行高效提取。
文庫構(gòu)建
TransNGS? Microbiome DNA Library Prep Kit for Illumina?
針對Illumina高通量測序平臺開發(fā)的，適用于1 ng從血液、肺泡灌洗液、痰液、鼻咽或口咽拭子、胸腹水、腦脊液、羊水等生物樣品中獲取的微生物基因組DNA進(jìn)行文庫制備的試劑盒。
產(chǎn)品特點：
? 建庫用量低：僅需1 ng DNA即可建庫。
? 適用樣本廣泛：血液、痰液、鼻咽或口咽拭子等多種來源的樣本DNA均可達(dá)到較好的建庫效果。
? 建庫時間短：90 min即可完成文庫構(gòu)建。
? 無偏好性：建庫測序結(jié)果與預(yù)期一致。
宏基因組建庫原理圖
多樣本建庫峰型
使用 TransGen 和 Company V 產(chǎn)品分別以 1 ng 口咽拭子、痰液和血液的基因組為樣本進(jìn)行文庫構(gòu)建。
臨床模擬樣本建庫
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